Efektivní explorace chemického prostoru s využitím vícekriteriální optimalizace

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-29032P

Název projektu anglicky

Efficient chemical space exploration using multi-objective optimization

Anotace anglicky

Recently, we have developed a method for a systematic generation of the chemical space lying between a given pair of molecules. The intended use follows a similar property principle, i.e., if a pair of molecules shows a similar function molecules close in the chemical space should behave alike. In the proposed project we would like to tackle two drawbacks of the original approach - 1) a path (subspace) between the input molecules is not guaranteed to be found and 2) the exploration process is driven purely by structure. To solve the first problem we propose to use scaffold hopping inspired approach. We will utilize multiple scaffold types retaining different levels of structural information to reduce the complexity of the chemical space. Second issue will be solved using multi-object optimization to modify the exploration process which will be performed in the biologically more relevant space of physico-chemical features (e.g. ADME/Tox). Finally, we propose a way how to mix scaffold hopping and bioactivity based exploration into a novel chemical space exploration approach.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

IN - Informatika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl zaměřen na problém explorace chemického prostoru, bylo dosaženo výsledků zejména algoritmické a implementační povahy. Projekt má výrazný chemický přesah, je však i informaticky relevantní. Publikační a funkční výstupy projektu lze hodnotit jako vynikající, čerpání finančních prostředků bylo v souladu s pravidly a očekáváními panelu.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GP-U/01:1

Datum dodání záznamu

30. 6. 2017

Celkové uznané náklady

1 897 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 897 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč