Strukturně funkční vztahy bílkovin
Cíle projektu
Navrhovaný postup analýzy vztahů struktury a funkcí bílkovin je založený na sjednocení dostupných údajů o struktuře bílkovin, vyjádřenou vlastnostmi bílkovinných sekvencí, a údajů o funkcích bílkovin, do jednotné formy, umožňující jejich analytické využití. Využitelné zdroje údajů o struktuře a funkcích bílkovin se značně liší povahou. Mohou jimi být laboratorní pokusy, literatura, počítačové databáze. Dostupná data mají tedy různé formy i formáty, často vzájemně neslučitelné, znemožňující důkladnoanalýzu. Nejpřirozenější - často jedinou možnou - formou údajů o struktuře a funkcích bílkovin je popis slovy. Chceme využít této skutečnosti, a pomocí formálního symbolického jazyka sjednotit dostupné znalosti o struktuře a funkcích bílkovin formou slovníchpopisů, které je možné kvantitativně porovnávat. Jejich porovnávání umožní seskupovat bílkoviny na základě strukturní a funkční podobnosti. Zobecněné vlastnosti skupin bílkovin lze použít k analýze vztahu struktury a funkcí bílkovin. V případě,
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Postdoktorandské granty
Veřejná soutěž
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Structure-function relationship of protein
Anotace anglicky
The proposed method for the study of structure-function relations of proteins is based on an integration of information available on protein structure, given by the protein sequence, and protein function, into the unified form. Data sources on both structure and function of proteins are of diverse nature as laboratory experiments, literature, computer databases etc.. Data have different forms, incompatible with each other, making a comprehensive analysis impossible. The most native - often only feasible- form of information on structure and function of proteins is a description by words. We want to use this fact to integrate available information on structure and function of proteins into descriptors od a symbolic language, which can be quantitativelycompared. Their comparison will allow to group proteins on the basis of structural and functional similarities. Generalized structural and functional features of protein groups can be used to analyze structure-function relationships of ind
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
EI - Biotechnologie a bionika
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
20801 - Environmental biotechnology
20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management
20803 - Environmental biotechnology related ethics
20901 - Industrial biotechnology
20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation
20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials
30101 - Human genetics
30401 - Health-related biotechnology
30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)
30405 - Medical biotechnology related ethics
40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology
40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming
40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt byl předčasně ukončen na žádost řešitel (dlouhodobý zahraniční pobyt). Vzhledem k tomu, že výsledky řešení projektu byly na vysoké odborné úrovni a závěrečná zpráva kvalitně zpracována (doložen i rukopis připravované publikace), doporučujeme hodn
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2001
Ukončení řešení
1. 1. 2003
Poslední stav řešení
S - Zastavený (předčasně ukončený) víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2002/GA0/GA02GP/U/N/6:2
Datum dodání záznamu
19. 11. 2002
Finance
Celkové uznané náklady
325 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
325 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
12 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
325 tis. Kč
Statní podpora
325 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2001 - 01. 01. 2003