Interakce rRNA promotorů s RNA polymerázou u Bacillus subtilis: definování elementů důležitých pro regulaci

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 5 (SGA02005GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/05/P510

Název projektu anglicky

Interaction of Bacillus subtilis rRNA promoters with RNA polymerase: Defining elements required for regulation

Anotace anglicky

ln rapidly growing bacteria, the ribosomal rRNA (rRNA) operons can account for more the 60% of all transcription. Given this large investment in rRNA transcription, RNA polymerase (RNAP) and rRNA promoters must have evolved together to accommodate rRNA synthesis. Under poor nutrition condition, however, rRNA promoters decrease dramatically their activity. Recent experiments revealed that in Bacillus subtilis, unlike in Escherichia coli from which we derive most of our knowledge about rRNA transcriptionregulation, the rRNA care promoter region (-35, -10) is responsible for both strength and regulation. DNA elements identified in E. coli to be responsible for rRNA promoter regulation, namely the 16 bp spacer and the GC-rich discriminator, are absent fromB. subtilis. I propose to define the DNA elements responsible for regulation of rRNA promoters in the gram-positive bacterium B. subtilis. Subsequently, I would like to determine the interactions of these elements with RNAP to gain a better

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem řešení projektu bylo definování elementů důležitých pro regulaci rRNA promotorů iniciačními nukleosid trifosfáty u Bacillus subtilis. Tento cíl se podařilo dosáhnout. V průběhu řešení se studovaná tematika rozdělila na dva nosné projekty:(i) DNA de

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 5. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-GA0-GP-U/03:2

Datum dodání záznamu

17. 10. 2008

Celkové uznané náklady

1 174 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 174 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč