PODJEDNOTKY URČUJÍCÍ DNA SPECIFICITU BAKTERIÁLNÍ RNA POLYMERÁZY S FLEXIBILNÍMI DOMÉNAMI: FUNKCE A DYNAMIKA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut<br>Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-16842S

Název projektu anglicky

DNA SPECIFICITY-DETERMINING SUBUNITS OF BACTERIAL RNA POLYMERASE WITH FLEXIBLE DOMAINS: FUNCTION AND DYNAMICS

Anotace anglicky

In G+ bacteria, the delta and sigma subunits of RNA polymerase (RNAP) are critical determinants of its specificity for DNA promoter sequence. Both the delta and vegetative sigmaA (SigA) subunits contain domains that move relative to the rest of the protein. Recently, we solved the 3D structure of delta, a two-domain protein, from the model G+ bacterium Bacillus subtilis, we described the effects of delta on transcription from several selected promoters, and we identified the approximate region on RNAP where delta binds – in the vicinity of SigA. We propose to determine the genome-wide effects of delta on transcription, dissect the functional roles of the two domains of delta, and build a structural model of delta and SigA in complex with RNAP that will describe the dynamics of the flexible parts of these two proteins and their mutual interplay. This will allow to create a comprehensive model of the cellular role of delta. It will advance our understanding of the transcription machinery of G+ bacteria that contain many medicinally and industrially relevant species.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt výborně rozvržený se signifikantními výsledky splňující náročná kritéria demonstrovaná publikacemi ve špičkových časopisech. Důležitý příspěvek k objasnění transkripční mašinerie v bakteriích.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

11 495 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 495 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč