RNA polymeráza: Průsečík regulačních sítí

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P302-11-0855

Název projektu anglicky

RNA polymerase: The ?meeting point? of regulatory networks

Anotace anglicky

Understanding the key molecular players in bacteria is crucial for the development of novel antibacterial compounds. RNA polymerase (RNAP) is essential for gene expression. Recently, we have solved the structure of the delta subunit of RNAP from Bacilussubtilis and unraveled its cellular role. In the course of these studies we identified a protein interacting with delta as well as other proteins interacting with RNAP. Here, we propose to study the structure-function relationship of RNAP from Bacillus subtilis with the following proteins: (i) omega1, a subunit of RNAP of which little is known; (ii) TRAP, an extensively studied protein involved in amino acid metabolism whose interaction with RNAP was previously unsuspected; (iii) SP_2234, a protein of unknown function that we identified to interact with delta; and (iv) Yvgs, a putative helicase that we identified to interact with RNAP. The proposed project will investigate the physiological role(s) of interactions of these proteins with RNAP by biochemical, genetic, and structural approaches. The project will advance our understanding of RNAP as a hub where various types of signals converge, are interpreted, and affect the transcriptional output. The new knowledge may aid in designing novel antibacterial compounds targeting RNAP and its function.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl zame?r?en na objasne?ni? funkce nove? identifikovany?ch faktoru? interaguji?ci?ch s RNA polymerázou. Údaje na závěrečné kartě projektu jsou validní a adekvátní. Tento projekt vy?znamne? rozs?i?r?il nas?e znalosti o bakteria?lni?ch transkripc?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

8 905 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 905 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč