Neuspořádanost proteinových struktur vnáší řád do bakteriální transkripce

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202200004

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

22-12023S

Název projektu anglicky

Structural protein disorder brings order into bacterial transcription

Anotace anglicky

Our knowledge of intrinsically disordered proteins (IDPs) is still in its infancy. The delta subunit of bacterial RNA polymerase (RNAP), containing an intrinsically disordered C-terminal domain (CTD), is a prime example of such a protein. Delta is important for regulation of transcription and cell survival in competitive environments. Yet, despite extensive studies of this protein, interactions of CTD with RNAP and their role in transcription are virtually unknown. We propose to (1) solve so far unknown structures of transcription initiation complexes of B. subtilis RNAP with delta and the primary sigma factor (SigA) using cryo-electron microscopy (cryo-EM), (2) structurally and functionally characterize delta of pathogenic S. aureus, whose sequence differs from other species, and (3) describe dynamics, intermolecular interactions, and consequently the role of delta CTD in initiation complexes containing RNAP-SigA by nuclear magnetic resonance and/or cryo-EM. This study will thus bring urgently needed information about the function of IDPs in the key process of transcription.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2022

Ukončení řešení

31. 12. 2024

Poslední stav řešení

K - Končící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

10. 3. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

11 997 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 997 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč