Fázová separace kapalina-kapalina a přirozená neuspořádanost proteinů v bakteriální transkripci

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202500001

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

25-16037S

Název projektu anglicky

Protein liquid-liquid phase separation and intrinsic disorder in bacterial transcription

Anotace anglicky

Liquid-liquid phase separation (LLPS) of proteins results in condensates that play key roles in the cell. LLPS often depends on intrinsically disordered proteins. Very little is known about LLPS in bacteria. Recently, we observed unexpected LLPS of a partially disordered mycobacterial sigma factor (SigA, an RNAP subunit) in vitro, suggesting that the bacterium may utilize LLPS to organize its transcription machinery. Moreover, we identified a so far unknown transcription factor (UCP7) from the same bacterium that consists of structured and disordered parts. We propose to investigate the relevance of LLPS in bacterial transcription using Mycobacterium smegmatis as the model system. We will describe the dynamics of SigA and UCP7 proteins and characterize their ability to form LLPS. We will define roles of their unstructured parts in transcription. Collectively, the project will provide a comprehensive model of the functioning of unstructured parts of the bacterial transcription machinery and reveal whether/how LLPS affects prokaryotic gene expression.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2025

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

10. 3. 2025

Celkové uznané náklady

17 467 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

17 467 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč