Funkční analýza methyltransferázy účastnící se modifikace SL RNA u Trypanosoma brucei
Cíle projektu
SL RNA u trypanosomatid má významnou roli při "trans-sestřihu" a úpravách mRNA. SL RNA poskytuje každé mRNA tzv. SL sekvenci. SL sekvence je krátký úsek SL RNA charakterizovaný m7G čepičkou na 5´-konci následovanou 4 nukleotidy nesoucími sedm methylových skupin. Tato SL RNA čepička je označována jako "cap 4" a je mezi eukaryotickými organismy jedinečná. RNA methyltransferázy, které katalyzují modifikace SL sekvence u trypanosom jsou rovněž unikátní. Je pravděpodobné, že tyto enzymy, účastnícíse modifikace SL sekvence, hrají hlavní roli v regulaci dostupnosti SL RNA pro "trans-sestřih" a mohou tak být důležitými aktéry v regulaci tohoto zásadního procesu. Během posledních let bylo charakterizováno několik enzymů účastnících se modifikace čepičky SL RNA. Cílem tohoto projektu je analyzovat funkci potenciální methyltransferázy MT420 účastnící se modifikace SL sekvence u Trypanosoma brucei - významného parazitického prvoka savců.
Klíčová slova
T. bruceimethyltranserasesSL RNAtrans-splicingcap structureRNA interference
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Postdoktorandské granty
Veřejná soutěž
Postdoktorandské granty 8 (SGA02008GA1PD)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
204/08/P585
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Functional analysis of methyltransferase involved in SL RNA modification in Trypanosoma brucei
Anotace anglicky
The trypanosomatid SL RNA plays an essential role in trans-splicing and processing of all mRNA. SL RNA provides the m7G-capped SL sequence to the 5'end of every mRNA. The cap structure of the SL RNA is unique in eukaryotes with 4 nucleotides after the m7G cap carrying a total of seven methyl groups and by convention is referred to as "cap 4". The RNA methyltransferases that catalyze cap 4 modifications are unique to trypanosomatids. It is likely, that the enzymes involved in cap 4 formation, play a pivotal role in regulating the availability of trans-splicing "competent" SL RNA and, therefore, these enzymes might be major players in regulating trans-splicing activity as a whole. Recently, several cap 4 modifying enzymes have been characterized. Theaimof this project is to analyze the function of potential SL RNA methyltransferase MT420 in Trypanosoma brucei. The specific aims of the project involve investigation of a role of MT420 for SL RNA biogenesis and trans-splicing, determination its
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Zhodnocení výsledků projektu
Tento projekt byl zaměřen na charakterizaci domnělé methyltransferázy MT420 u bičíkovce Trypanosoma brucei, původce spavé nemoci lidí a nemoci nagana u zvířat. Methyltransferáza MT420 měla původně hrát významnou roli v methylaci 5?čepičky mRNA u tohoto ?
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2008
Ukončení řešení
31. 12. 2010
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
16. 4. 2010
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Datum dodání záznamu
20. 3. 2015
Finance
Celkové uznané náklady
1 035 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 035 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
1 035 tis. Kč
Statní podpora
1 035 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2008 - 31. 12. 2010