Studium fotosyntetických reakčních center metodami molekulárního modelování
Cíle projektu
V navrhovaném projektu budou použity metody molekulárního modelování ke studiu struktury a dynamiky primárních fotochemických reakcí v reakčních centrech fotosyntetických komplexů. Výsledky výpočtů budou porovnány s experimentálními daty získanými nanašem pracovišti. Navržené výpočetní metody molekulárního modelování mohou přispět ke komplexnějšímu pochopení strukturně funkčních vztahů ve fotosyntetických reakčních centrech doplněním znalostí, které nelze odvodit ze strukturních dat nebo jinýchdostupných biofyzikálních a biochemických studií. Jedná se především o získání poznatků o dynamice a energetických a elektronových stavů v reakčních centrech při separaci a akumulaci náboje. V tomto projektu bude studováno rozložení náboje na primárnímakceptoru feofytinu a jeho vliv na bezprostřední proteinové okolí. Budou simulována absorpční spektra a spektra cirkulárního dichroismu. Porovnáním těchto spekter s experimentem budou studovány energetické a elektronové stavy v jádru reakčního centra
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Postdoktorandské granty
Veřejná soutěž
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Hlavní účastníci
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Ústav fyzikální biologie
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Photosynthetic reaction centres studied by means of molecular modelling methods
Anotace anglicky
In this project molecular modelling methods will be used to study the structure and dynamics of the primary photosynthetic reactions in the reaction centres. The computational results will be compared to the experimental data. The suggested molecularmodelling methods will contribute to the understanding of the structural and functional relations in the photosynthetic reaction centres. The computation methods can provide data which cannot be obtained by standard biophysical and biochemical methods asthedynamics and energetic and electronic states in the reaction centres at charge separation and accumulation. In this project the charge distribution on the primary electron acceptor and its influence on the surrounding protein environment will bestudied.The absorption and circular dichroism spectra will be simulated. The energetic and electronic states of the reaction centres will be studied by comparing these spectra with those obtained by experiment. The last aim of this project is to follow
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
CH - Jaderná a kvantová chemie, fotochemie
CEP - další vedlejší obor
ED - Fyziologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10402 - Inorganic and nuclear chemistry
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30105 - Physiology (including cytology)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Na základě molekulárně modelovacích, kvantově chemických a simulačních výpočetních technik byly studovány spektrální vlastnosti fotosyntetického reakčního centra (RC) a děje probíhajících v RC při procesu separace náboje. 1. Výsledky výpočtů absorpčních
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2002
Ukončení řešení
1. 1. 2005
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP06-GA0-GP-U/06:6
Datum dodání záznamu
19. 5. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
1 599 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
599 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 000 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
1 599 tis. Kč
Statní podpora
599 tis. Kč
37%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
CE - Biochemie
Doba řešení
01. 01. 2002 - 01. 01. 2005