Identifikace enkapsidačního signálu a proteinů zúčastněných při enkapsidaci DNA v průběhu virové morfogeneze myšího polyomaviru.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 10 (SGA02010GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P302-10-P118

Název projektu anglicky

Identification of cis-acting signal and trans-acting proteins involved in DNA encapsidation and viral assembly of mouse polyomavirus.

Anotace anglicky

The project focuses on the mouse polyomavirus virion assembly process. The aim of this proposal is to identify cis-acting DNA signal sequence for encapsidation of viral genome as well as trans-acting protein/s involved in virion assembly. The experimental system for identification these elements is based on the transduction of reporter gene by way of pseudovirions produced in specially designed cell line. Several experimental methods for verification of requirement of these elements in viral genome encapsidation are proposed. These include site directed mutagenesis of the encapsidation signal sequence, electrophoretic mobility shift assay and chromatin immunoprecipitation (ChIP) procedure for confirmation of trans-acting protein/s binding to the encapsidation sequence. The specific role of trans-acting protein/s in virion assembly will be clarified in the series of experiments in the cell line with regulated level of selected protein/s prepared by RNA interference technology. Moreover, the significance of newly identified elements in a design of the mammalian gene delivery system will be evaluated.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Přínosem projektu je zjištění, že u různých polyomavirů se uplatňují rozdílné mechanismy pro enkapsidaci DNA. U myšího polyomaviru se, oproti původním předpokladům, nepodařilo prokázat specifický enkapsidační signál. Byl vyvinut originální rekombinační ?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

8. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GP-U/02:2

Datum dodání záznamu

6. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 298 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 298 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč