Tetraplexy DNA a jejich výskyt v lidském genomu

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Tetraplexes of DNA and Their Occurrence in the Human Genome

Anotace anglicky

Tetraplex is a biologically active alternative of the DNA double helix. Studies of, so far, a small part of the human genome indicate that it contains thousands of sequences prone to tetraplex formation. In this project, we wuggest to examine selected series of DNA fragments and formulate rules according to their behavior for a prediction of nucleotide sequences and the solution conditions leading to monomolecular or bimolecular tetraplex formation. These rules will eliminate discrepancies existing in the literature and result in a better understanding of principles of tetraplex formation. Using these rules we will find nucleotide sequences in the human genome prone to tetraplex formation. Some of the sequences will be subjected to experimental tests to check how the tetraplex prediction rules work.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

BO - Biofyzika

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Formulovali jsme pravidla skládání čtyř bloků G3 do různých typů tetraplexů v závislosti na sekvenci bázi mezi nimi. Detegovali jsme a charakterizovali řadu tetraplexů ve fragmentech lidského genomu a v dalších důležitých sekvenčních motivech DNA.

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-AV0-IA-U/03:3

Datum dodání záznamu

3. 4. 2009

Celkové uznané náklady

5 078 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 524 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 554 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč