Úloha cytosinu v konformační polymorfii DNA

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Role of cytosine in the conformational polymorphism of DNA

Anotace anglicky

By CD spectroscopy and PAGE we propose to study the problems with synthetic cytosine-rich NA fragments: Characterization of a thermostable conformer that oligo(dC) forms at neutral pH, and its role in the formation of cytosine i-quadruplex. The anomalousconformation of d(CnGn) oligonucleotides.Duplex,G-quadruplex and i-quadruplex formation in the d(CnGn) and d(GnCn) fragments of DNA, their competition and intramolecular coexistence. Bimolecular duplex-foldback equilibria in the (G+C) - rich oligonucleotides. Unusual conformations of the regulerly alternating d(IC)n, d(TC)n and d(AC)n motifs. Role of alkyl, alkenyl and alkynyl substituents in position 5 of cytosine in the conformational properties of the oligonucleotides. Comparison of crystal and solution conformations of G+C)-rich DNA fragments.These studies will help to understand the role of cytosine clustering, protonation, methylation and regular alternation in the conformational polymorphism of cytosine-rich genomic regions.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Zjistili jsme, že molekuly DNA začínající blokem cytosinů nabývají zvláštní dvojité šroubovice, která se podobá RNA. Ukázali jsme, že podmínky, v nichž existuje DNA v krystalech, lze simulovat vodným roztokem trifluorethanolu.

Zahájení řešení

1. 1. 1997

Ukončení řešení

1. 1. 1999

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2000/AV0/AV00IA/U/6:3

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

3 750 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 425 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč