Strukturní studie proteinových domén opičího retroviru

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 3 (SAV02003-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA4055304

Název projektu anglicky

Structural study of protein domains of monkey retrovirus

Anotace anglicky

Temporal and spatial separation of assembly of immature capsid particles from their release makes Mason-Pfizer monkey virus (M-PMV), inducing an AIDS like syndrom in non-human primates, an attractive experimental model for the study of retroviral capsidassembly and its maturation. Here we propose to study the 3D structure of the scaffolding protein p12 and the 13 kDa form of M-PMV protease (PR) using isotopicaly aided NMR spectroscopy. The role of the C-terminal extension of PR on its structure and higher proteolytic activity compared to the 3D structure of 12 kDa PR will be determined. We will also investigate the role of PR truncations in the virus life and the liberation of the M-PMV PR from the polyprotein precursors and its activation using tissue culture experiments. Using bacterial and in vitro assembly system we will determine the molecular mechanism and structure/function relations of Gag-derived domains involved in the assembly of retroviral capsid.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla vyřešena 3D struktura M-PMV proteasy a M-PMV NC dUTPasy pomocí NMR a krystalografie. Určili jsme strukturní motivy M-PMV integrasy důležité pro vazbu inhibitorů.

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

28. 6. 2013

Celkové uznané náklady

11 354 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 282 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

7 072 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč