Mutační analýza chromozomálního HMG1-box B motifu specifického pro různé struktury DNA

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Mutational analysis of structure-specific DNA-binding HMG-box B motif of nonhistone chromosomal protein HMG1

Anotace anglicky

The HMG (high mobility group) domain has recently been identified as a new DNA-binding motif in a number of DNA-binding proteins and transcription factors. Chromosomal protein HMG1 contains two HMG-box domains (A and B) exhibiting a considerable selectivity for DNA structures containing sharp bend or kinks. Based on the published NNMR structure of the HMG box domain B and comparison of the HMG box domains from a number of evolutionary distant organisms (such as yeast, fish, birds and mammals) wehave proposed a mutational analysis of more than 15 highly conserved amino acids within the rat HMG1 box domain B. The recombinant rat HMG box mutants (produced in E. coli) will be studied for their ability to bind DNA four-way junctions and bent DNA (modified by the anticancer drug cisplatin), to bend, loop and compact DNA as well as to induce DNA supercoiling in the presence of topoisomerase I in vitro.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly identifikovány aminokyseliny N-terminální sekvence B-domény proteinu HMG1 nezbytné pro rozpoznání ohnuté DNA (lyzin96/arginin97) a indukcí ohybu DNA (lyzin90).

Zahájení řešení

1. 1. 1996

Ukončení řešení

1. 1. 1998

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/1999/AV0/AV09IA/V/3:3

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

1 865 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 462 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč