Objasnění vazby transkripčního faktoru RNA polymerázy I xUBF s DNA

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 1 (SAV0-AB2001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Understanding of binding of RNA polymerace I transcription factor xUBF to DNA

Anotace anglicky

Xenopus upstream binding factor (UBF) is an RNA polymerase I-specific transcription factor of ribosomal genes, containing five DNA binding domains (HMG box) which are exxential to promote transcription of tibosomal genes. The xUBF can bind and actively form DNA crossorvers, and to induce DNA bending and looping. The biological relevance of DNA looping and formation of DNA crossovers could be in bringing far-upstream enhancers and their cognate promoters together, and/or in establishing a stable pre-initiation complex in the promoter region of fDNA genes. The aim of the proposed project is to elucidate a mechanism by which the individual HMG boxes of the xUBF could assemble DNA crossvers, and to loop and supercoil DNA. In addition, chimeric hybrids (a "domain-swap") of the major DNA-binding motif of xUBF, HMG box 1, and that of the domain B of the closely related chromosomal protein HMG1 will be employed with the aim to get a detailed insight into the interaction of the HMG box with DNA.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Naklonovali jsme cDNA HMG-box domén transkripčního faktoru UBF. Mutační analýza umožnila objasnit význam některých konzervativních aminokyselin pro interakci s DNA a proteiny. Identifikovali jsme nový vazebný substrát pro UBF - hemikatenátové smyčky DNA.

Zahájení řešení

1. 1. 2001

Ukončení řešení

1. 1. 2003

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2004/AV0/AV04IA/U/N/3:2

Datum dodání záznamu

13. 10. 2004

Celkové uznané náklady

4 181 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 373 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 808 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč