Acetylace histonů a struktura rostlinného buněčného jádra
Cíle projektu
Recentní údaje naznačují, že konstitutivní i fakultativní heterochromatin mají hypoacetylovány histony H4 a H3, zatímco jejich hyperacetylace označují potenciálně aktivní chromatinové oblasti. S použitím antišér vůči odlišně acetylovaným izoformám histonů budeme imunocytochemickými analýzami sledovat acetylaci chromozómů a interfázových jader, abychom zmapovali jejich euchromatinové a heterochromatinové domény. Na různých modelových systémech (pohlavní chromozómy dvoudomých rostlin Melandrium album a Rumex acetosa, rostlinné orgány a pletiva v různém stádiu ontogeneze) bude studován stav acetylace histonů a korelován s genově bohatými doménami, telomerickými a centromerickými oblastmi heterochromatinu, buněčným dělením a metabolickou aktivitou, programovanou buněčnou smrtí a dalšími modifikacemi chromatinové struktury. Po aplikaci inhibitorů histon-deacetyláz budeme sledovat stabilitu indukovaných acetylačních změn (imunohistochemicky, Western- a ELISA-analýzami).
Klíčová slova
nucleusplantdevelopmenthistone acetylationDNA methylationSileneArabidopsis;
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Nuclear Structure and Histone Acetylation in Plant Cells
Anotace anglicky
Recent data indicate that H4 and H3 histones are underacetylated in both constitutive and faculative heterochromatin, while their hyperacetylation marks potentially active gene regions. Using antisera directed against acetylated isoforms of H4 and H3 andindirect immunocytochemistry we will analyse histone acetylation patterns on chromosomes and interphase nuclei to map euchromatin and heterochromatin regions. Plants offer a variety of powerful model systems that can be used to study mechanisms in differentiation and development. These include sex chromosomes of dioecious Melandrium album and Rumex acetosa, and various organs and tissues at different stages of plant development. Histone acetylation status will be studied and corrrelated with gene richchromosome domains, telomeric and centromeric heterochromatin, cell division and metabolic activities, programmed cell death and other modifications of chromatin structure.
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
ED - Fyziologie
CEP - další vedlejší obor
EF - Botanika
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Prokázali jsme vzájemnou korelaci hyperacetylace histonů, hypometylace cytosinu a časné replikace genově bohatých oblastí jádra. Naproti tomu konstitutivní a fakultativní heterochromatin byl demonstrován jako H4 hypoacetylovaný a DNA hypermetylovaný.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 1999
Ukončení řešení
1. 1. 2002
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2003/AV0/AV03IA/U/N/5:3
Datum dodání záznamu
27. 10. 2004
Finance
Celkové uznané náklady
4 366 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 079 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
2 137 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 366 tis. Kč
Statní podpora
2 079 tis. Kč
47%
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 1999 - 01. 01. 2002