Aktivita a inhibice mobilních elementů v savčích buňkách.

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA501110701

Název projektu anglicky

Activity and silencing of mobile elements in mammalian cells.

Anotace anglicky

This project has four related but sufficiently independent parts: Part I uses bisulfite sequencing and chromatin IP on human samples (biopsies, and stable cell lines) to address natural epigenetic modifications of the six potentially most active human L1elements. It will also study transcription and its regulation at these six loci. Part II employs bisulfite sequencing of mouse DNA (different tissues and developmental stages) to map epigenetic reprogramming of the transgenic human L1 element and its retrotransposed de novo insertions during the mouse life cycle. Part III focuses on using L1 retrotransposition model in cell culture to study mechanisms involved in the control of L1 silencing and to analyze possible inhibitory effects of simultaneous expression of both RNA strands. Part IV will address (in cell culture) whether several L1 inverted repeats dispersed in the human genome generate double-stranded RNA, which in turn may contribute to L1 silencing.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V lidském genomu existují stovky aktivních L1 promotorů, ale elementy kompetentní pro retrotranspozici jsou epigeneticky umlčené. L1 promotory mají komplexní regulaci, která zahrnuje antisense transkripci. L1 elementy nejsou inhibované RNA interferencí.

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-AV0-IA-U/01:1

Datum dodání záznamu

8. 6. 2010

Celkové uznané náklady

3 921 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 765 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

156 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč