Neobvyklé konformace fragmentů DNA bohatých na guanin
Cíle projektu
V eukaryontních genomech se frekventně vyskytují sekvenční motivy (G)n a (GA)n. In vitro tvoří modiv (G)n kvadruplexy, triplexy a neobvyklou strukturu mající rysy A-formy. Motiv (GA)n tvoří paralelní a antiparalelní duplexy obsahující páry GG, AA a GA. Pomocí CD spektroskopie, elektroforézy, počítačového modelování a dalších metod budou zkoumány fragmenty DNA obsahující různé varianty sekvenčních motivů (G)n a (GA)n s cílem odhalit zákonitosti jejich izomerizací do výše uvedených neobvyklých struktur včetně vlivu detailů jejich sekvence nukleotidů a podmínek v roztoku (pH, divalentní ionty, délka a koncentrace oligonukleotidů, atd.). Zvláštní pozornost bude věnována studiu okolností, za kterých tyto motivy preferují tvořit výše uvedené neobvyklé struktury před kanonickým duplexem s komplementárními sekvencemi bází.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
—
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Unsual Conformations of Guanine-Rich DNA Fragments
Anotace anglicky
—
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
9F - 9
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 1994
Ukončení řešení
1. 1. 1996
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/1997/AV0/AV07IA/V/9:4
Datum dodání záznamu
—
Finance
Celkové uznané náklady
349 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
535 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
349 tis. Kč
Statní podpora
535 tis. Kč
153%
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
CEP
CE - Biochemie
Doba řešení
01. 01. 1994 - 01. 01. 1996