Gen ybxF, nově identifikovaný člen streptomycinového operonu u Bacillus subtilis

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Gene ybxF, a newly identified member of the streptomycin operon of Bacillus subtilis

Anotace anglicky

The streptomycin (str) operon, one of the most conserved operons in prokaryotic evolution, is in E. coli composed of four house-keeping genes: rpsL, rpsG, and fus, tufA, coding for ribosomal proteins S12, S7, and elongation factors EF-G, EF-Tu, respectively. Our studies revealed that str operon of gram-positive B. stearothermophilus and B. subtilis carries at its 5' end an additional gene, designated ybxF. Its transcription affected expression of other four genes of the operon. ybxF codes in both organisms for a protein of unknown function. The gene is also present in some other gram-positive bacteria but gram-negative bacteria have no homologue of ybxF. A complex study of bacillar ybxF significance is proposed: 1) B. subtilis with removed (knocked-out) abyF gene will be generated and characterized, 2) consequences of ybxF protein overproduction for growth and transcription will be examined, 3) ybxF protein will be isolated, tested and crystallized to detemine its 3D structure.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

N - Nesplněno zadání

Zhodnocení výsledků projektu

První gen streptomycinového operonu Bacillus subtilis, nazvaný ybxF, je neesenciálním genem kodujícím malou ribosomální bílkovinu o 82 aminokyselinách. Protein GreA inhibuje aktivitu RNA polymerázy B. subtilis při iniciaci z rrn promotorů in vitro.

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-IA-U/04:2

Datum dodání záznamu

26. 9. 2007

Celkové uznané náklady

3 581 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 327 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 254 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč