Analýza haplotypů u divokých myší a z nich odvozených kmenů na chromozomu 17

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 4 (SAV02004-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA5052406

Název projektu anglicky

Analysis of haplotypes in wild and wild-derived mice on chromosome 17

Anotace anglicky

This project proposal is based on the results of our laboratory and on the availability of DNAs from wild-derived strains and wild mice. The aims are to look for alleles/genotypes and their combinations on a single chromosome of a given individual (haplotypes) in the mouse genome. Tightly-linked polymorphisms will be found in Mus m. domesticus and M. m. musculus to estimate the number of alleles. In pilot experiments, the haplotype structure of wild-derived strains will be analyzed by screening the alleles and regions of possible linkage disequilibrium (LD; the nonrandom association of alleles in haplotypes) identified. Larger scale experiments will be performed in the regions of high LD. The data will be compared with the human haplotype map. The results are expected to aim the understanding of mammalian genome organization and the mechanisms involved in recombination, to clarify the usefulness of wild-derived strains in positional cloning projects, and to develop new markers.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla zkonstruována haplotypová mapa oblasti myšího chromosomu 17 o délce 250 kb. Haplotypové struktury se lišily nejen mezi druhy, ale i mezi poddruhy myši domácí. Přispělo to k identifikaci prvního genu hybridní sterility u obratlovců, Hst1.

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

31. 12. 2008

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

21. 2. 2008

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP09-AV0-IA-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2009

Celkové uznané náklady

3 396 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 146 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 250 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč