Evoluce sekundárního metabolismu u aktinomycet: průzkum a využití genetické variability

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 5 (SAV02005-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA600200519

Název projektu anglicky

Evolution of secondary metabolism in actinomycetes: exploitation of genetic variability

Anotace anglicky

Diversity of secondary metabolism genes in actinomycetes will be assessed together with 16S rDNA genes diversity in environmental DNA of soils from extremely diverse habitats. Soil samples will be also subjected to the isolation of bacteria. Directed selection of isolates will establish a diversified collection of soil actinomycetes. In the obtained collection of species and strains, diversity of selected secondary metabolic genes coding for common enzymes, e.g. polyketide synthases, or rare ones, e.g.halogenases, will be determined. Phylogenetic trees constructed from sequences of the enzymes typical of secondary metabolism will be compared to those based on the 16S rDNA genes. Presence of the rare genes in the isolates will be correlated to the level of homology in the more common genes. Variability of the rare genes will be studied in relationship to the diversity of sampled habitats but also in relationship to preservation of their original function in the biosynthetic cluster.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Souvislost mezi taxonomickou a sekundárně metabolickou diversitou a antimikrobiální aktivitou byla zkoumána od společenstev po jednotlivé kmeny. Data o místní specifitě sekundárně metabolických a odpovídajících rezistenčních genů jsou hlavním přínosem.

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-AV0-IA-U/01:1

Datum dodání záznamu

8. 6. 2010

Celkové uznané náklady

3 127 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 127 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč