Evoluce chromosomů brukvovitých (Brassicaceae) analyzována pomocí komparativního chromosomálního paintingu

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA601630902

Název projektu anglicky

Chromosome evolution in crucifers (Brassicaceae) revealed by comparative chromosome painting

Anotace anglicky

Comparative chromosome painting (CCP) enables the identification of large homeologous chromosome regions shared among two or more species. In plants, the technique is only feasible in crucifers (Brassicaceae). This project will further our knowledge on the extent of cross-species chromosomal colinearity, scenarios and rates of karyotypic alterations within the plant kingdom. Karyotype evolution will be analyzed in relation to the Ancestral Crucifer Karyotype (ACK) and ancestral genomic blocks. For the first time, CCP will be applied to unveil the extent of infrageneric and intraspecific karyotypic variation. Putting CCP data into a molecular phylogenetic framework will significantly expedite our understanding of the role of the chromosomal reshufflingin plant diversification and speciation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Pomocí metody komparativního chromosomálního paintingu byly získány nové poznatky o rozsahu mezidruhové chromosomální kolinearity a evoluci karyotypu v čeledi Brassicaceae. Byly charakterizovány nové ancestrální genomy a celogenomové duplikace.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

29. 2. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

12. 2. 2014

Celkové uznané náklady

4 126 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 126 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč