Konstrukce knihovny DNA banánovníku klonované ve vektoru BAC (Bacterial artificial chromosome) pro fyzické mapování genomu

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Construction of banana bacterial artificial chromosome (BAC) library for physical genome mapping

Anotace anglicky

The project aims at producing of an ardered large-insert banana B-genome library. The library will be cloned in pECBACl vector. The final genomic library will be combination of three partial libraries constructed using various restriction enzymes. whichshould increase the real genome coverage. We will attempt in obtaining 30 000 - 35 000 clones with expected average insert size of 100 130 kb, which will represent wix equivalents to haploid genome. The library will be used for cytogenetic mapping with the aim to obtain cytogenetic markers to distinguish individual chromosomes and to saturate cytogenetic maps of banana. The acqured markers will permit analysis of chromosome evolution within the genus Musa for the first time. Integration of banana genetic and physical maps will be another achievement of the project. It is expected that the library wil be used intensively in other projects within the framework of international cooperation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly připraveny unikátní materiály pro genomiku banánovníku, zejména genomická knihovna DNA klonovaná ve vektoru BAC. S jejich pomocí byly získány nové poznatky o molekulární struktuře genomu této významné plodiny a jeho změnách v průběhu evoluce.

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-IA-U/04:2

Datum dodání záznamu

26. 9. 2007

Celkové uznané náklady

6 740 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 422 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

4 318 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč