Optimalizace procesu amplifikace DNA segmentů pomocí polymerázové řetězcové reakce

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Program podpory cíleného výzkumu a vývoje

Veřejná soutěž

Program podpory cíleného výzkumu a vývoje 2 (SAV02002-S)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Optimization of DNA segments amplification by polymerase chain reaction

Anotace anglicky

The polymerase chain reaction (PCR) is a versatile method for rapid amplification of selected DNA segments. To further simplify PCR set up and to increase PCR sensitivity and specificity we will study the role of additives for stability of premixed PCR solutions containing PCR buffer, nucleotides, and DNA polymerase at optimal concentrations (Master mixes). The additives will include inert stains, protease inhibitors, glycerol and/or other compounds to increase density of Master mixes, and tetramethylammonium oxalate which we recently described as new specificity and yield enhancer of PCR (Kovářová and Dráber, Nucleic Acid Research, 28: e70-74, 2000). We will also analyze the role of these additives on LA (long and accurate) PCR. Furthermore, two different so called PCR hot start methods will be compared. The combined data should provide a theoretical background for rational approaches for simple and reliable amplification of DNA and RNA in PCR and RT-PCR, respectively.

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

CEP - další vedlejší obor

CE - Biochemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla nalezena nová aditiva pro amplifikace DNA v barevných reakčních směsích pro PCR. Byly připraveny nové monoklonální protilátky specifické pro Taq DNA polymerázu. Jedna z těchto protilátek byla využita v novém komerčně dostupném výrobku.

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-IB-U/01:1

Datum dodání záznamu

19. 6. 2006

Celkové uznané náklady

2 028 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 960 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

68 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč