Stanovení prostorové struktury aspartátových proteáz Sap 9 a Sap 10 pomocí chemického zesítění a hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 3 (SAV02005-J)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

KJB400200501

Název projektu anglicky

Determination of the Three-Dimensional Structure of Secreted Aspartic Proteases Using Chemical Cross-Linking and High Resolution Mass Spectrometry

Anotace anglicky

The goal of this proposal is to determine the 3D structures of secreted aspartic proteases Sap9 and Sap10 (Saps), by chemical cross-linking and mass spectrometry (MS3D). Sap proteases are secreted by pathogenic yeast Candida albicans and they play an important role during fungal infections. In MS3D, inter-residue crosslinks are identified to provide large sets of inter-atomic distance constraints. Unlike X-ray and NMR techniques, proteins amenable to MS3D can have many domains, flexible regions, and post-translational modifications. Moreover, MS3D is not limiteited by auto-proteolysis due to rapid cross-link formation. On the example of the Saps we will show that MS3D is the method of choice for determination of the 3D structures of large glycosylatedproteases. The structural characterization will contribute to design specific inhibitors, candidates for antimycotic drugs.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Glykosylace aspartátových proteáz Sap9 a Sap10 byla určena. Byla vyvinuta nová metodologie identifikace disulfidických můstků v molekule proteinu a bylo zavedeno stanovení 3-D struktury proteinů pomoci chemického zesítění a hmotnostní spektrometrie.

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

1. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-AV0-KJ-U/02:2

Datum dodání záznamu

3. 4. 2009

Celkové uznané náklady

1 467 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 467 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč