Kvantifikace a lokalizace maternálních mRNA v časném vývoji drápatky (Xenopus)

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 4 (SAV02006-B)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

KJB500520601

Název projektu anglicky

Quantification and localization of maternal mRNAs in early development of Xenopus

Anotace anglicky

Cell determination during early development is a process that directly depends on protein and mRNA cell content and distribution. mRNA profiling is limited by small amounts of RNA in mammalian cells. On the contrary, single Xenopus early cells and eggs contain enough mRNA for extensive screening. I therefore, propose, by real-time PCR, to quantify mRNA levels of 40 highly expressed maternal genes at the level of individual cells from the egg to the stage of 16 cell embryos to create 3D temporal and spatial expression maps of mRNA distributions for the studied genes during early development. The maps will provide correlations between mRNA distributions and cell determination/fate. The maps will serve as a framework for studies of other maternal genes ofunknown function. These genes will be subsequently studied by functional analysis (RNAi or morpholino inhibition, and overproduction) to determine their function.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla vyvinuta nová metoda pro prostorové expresní profilování, nazvaná qPCR tomografie. Vajíčka a embrya Xenopus laevis byla použita pro vytvoření prostorové expresní mapy maternálních genů. Byly nalezeny pouze dvě skupiny různých lokalizačních profilů

Zahájení řešení

1. 1. 2006

Ukončení řešení

1. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-AV0-KJ-U/02:2

Datum dodání záznamu

3. 4. 2009

Celkové uznané náklady

720 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

720 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč