Analýza sekvencí a distribuce sobecké DNA v genomu motýlů (Lepidoptera).

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 7 (SAV02009-B)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

KJB501410901

Název projektu anglicky

Analysis of sequences and distribution of the selfish DNA in the genome of moths and butterflies (Lepidoptera).

Anotace anglicky

Genome size in moths and butterflies differs dramatically not only among distant species, but also in close relatives. This feature is general in eukaryotic organisms and is caused by different amounts of so called selfish DNA. The selfish DNAs are considered to be genome parasites, on the other hand they were repeatedly proved to play an important role in the evolution of their hosts. Moreover, they are necessary for proper function of some chromosomal structures. In spite of their importance and interest, the data on the selfish DNAs are underrepresented in Lepidoptera. Thus, we propose to isolate and characterize the selfish DNAs in selected lepidopteran species. We will gain more information on its sequences and distribution in the host chromosomesand presence in other species. The proposed techniques are: microdissection of the W chromosome, PCR amplification using TRAS1 primers, GSP-PCR, digestion of the genomic DNA via restriction nucleases, and Cot1 DNA cloning.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly nalezeny fragmenty vysoce repetitivních mobilních elementů v genomech tří motýlů, několik satelitních sekvencí, z nichž byly charakterizovány dva satelity z chromosomu W zavíječe paprikového a transkripčně aktivní satelit obaleče jablečného.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 3. 2011

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP12-AV0-KJ-U/01:1

Datum dodání záznamu

25. 5. 2012

Celkové uznané náklady

1 626 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 626 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč