Biosyntéza polyketidových řetězců asukamycinu: Možnosti tvorby hybridních antibiotik

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Biosynthesis of asukamycin polyketide chains: Prospects for hybrid antibotics

Anotace anglicky

Manumycin-type antibiotics, produced by some streptomycete strains, are mainly studied for their putative anticancer and antiinflammatory effects. The metabolites typically consist of two cyclic carbon unitslinked by two polyketide chains. Their biosynthetic pathway has already been proposed based on the experiments with radioactive precursors. However, the genes, encoding the pathways components, have not been studied yet. The project aim is, first, to map the gene cluster responsible for the asukamycin biosynthesis (on the basis of its partial knowledge) and to compare its structure with that of manumycin gene cluster, focusing on thebiosynthesis of polyketide chain moieties. Based on the results, second, to test the prospects of the directed biosynthesis of new hybrid asukamycin derivatives with the help of gene manipulation of the genes encoding relevant polyketide synthases of both producers, Streptomyces parvulus and Streptomyces nodosus var. asukaensis.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

CE - Biochemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výsledkem je identifikace a sekvenace shluku genů pro biosyntézu antibiotika manumycinu ze S. parvulus Tű64. Porovnáním s geny asukamycinového shluku byl vytvořen model syntesy polyketidových řetězců a připraveny konstrukty pro jeho ověření.

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-KJ-U/07:5

Datum dodání záznamu

12. 2. 2014

Celkové uznané náklady

1 267 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 109 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč