Nové manumyciny cestami specifického genetického screeningu přírodních izolátů streptomycet a kombinatorní biosyntézy
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT II
Veřejná soutěž
KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-6805/2013-311
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
New manumycins by means of the specific genetic screening of natural streptomycete isolates and of the combinatorial biosynthesis
Anotace anglicky
The aim of the project is to create a collection of producer strains synthesizing new manumycin-type compounds. About 1/3 - 1/2 of producers will be acquired by means of a genetic screening of streptomycete isolates from various biotopes. The rest shouldbe created based on known or newly discovered producers by methods of gene disruption, mutasynthesis a combinatorial biosynthesis. Next, transfer of entire biosynthetic gene clusters into specialized heterologous producers will be used. Heterologous production quite often affects amounts, structures and ratios of produced metabolites. All producer strains will be subjected to basic genetic characterization, targeted in the genes responsible for the variable components in the structure of manumycins, mainly in the upper polyketide chain, which is the main biological activity determinant. Next, basic parameters of cultivation, fermentation and produced metabolites spectrum will be determined, including structure assessments of their major metabolites.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
EI - Biotechnologie a bionika
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V projektu jsme testovali 1500 přírodních kmenů aktinomycet a 300 aktinomycetových genomů. Vytvořili jsme metodiku na detekce a klasifikace producentů látek s C5N. Získali jsme a dále částečně analyzovali 4 potenciální producenty manumycinů, 6 nových producentů jsme vytvořili kombinatoriální biosyntézou. Šest čistých látek prošlo testy protizánětlivých aktivit. Výsledky byly předmětem dvou impaktovanych článků a dvou patentových přihlášek.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 3. 2012
Ukončení řešení
31. 12. 2015
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
27. 2. 2015
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP16-MSM-LH-U/01:1
Datum dodání záznamu
9. 10. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
2 375 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 375 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč