Fylogenetické vztahy v rámci skupiny Myxosporea na základě kombinované analýzy sekvencí ribosomálních a proteinových genů: evoluce významné skupiny rybích parazitů

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 5 (SAV02007-B)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

KJB600960701

Název projektu anglicky

Phylogenetic relationships within Myxosporea inferred from combined analysis of ribosomal and protein gene sequences: evolution of important fish parasites

Anotace anglicky

The project is focused on phylogenetic analyses of myxosporeans - economically and phylogenetically important group of primitive metazoans infecting fish hosts. The main aim is to create the large dataset, which will consist of sequences of ribosomal (SSU and LSU rDNA) and protein genes (HSP70, MHC-II and EF2). The combined analyses may resolve some nodes which are not well supported in the single SSU rRNA gene analyses. The separate analysis of protein genes will be compared with the analysis of ribosomal genes. New sequences and more data could contribute to a better understanding of the relationships of individual myxosporean genera. Phylogenetic analyses of combined data will be performed using Bayesian inference, Maximum parsimony and Maximum likelihood.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EG - Zoologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Na základě analýzy sekvencí LSU rDNA a proteinového genu EF2 se podařilo potvrdit fylogenetickou analýzu myxosporeí, které byly dosud založeny na jediném genu SSU rDNA. Byla modelována předpokládaná evoluce morfologických a bionomických znaků myxozoí

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-AV0-KJ-U/03:3

Datum dodání záznamu

14. 6. 2011

Celkové uznané náklady

1 062 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 062 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč