Integrativní ekogenomika metabolického syndromu

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

NÁVRAT

Veřejná soutěž

NÁVRAT 1 (SMSM2012LK1)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-8056/2012

Název projektu anglicky

Integrative Ecogenomics of Metabolic Syndrome

Anotace anglicky

Obesity, hypertension, insulin resistance, dyslipidemia and their associated conditions have major share in the worldwide ill health. The common forms of these diseases, often clustering in an individual as the metabolic syndrome, are multifactorial (complex) traits with relatively balanced heritable and environmental components. Only recent developments of novel technological and bioinformatic tools including the concept of systems biology (together with the semantic expansion of the environment to include diverse entities from epigenomics to socio-economic status) provide an appropriate conceptual frame for dissection of major causative factors and mechanisms. We plan to pursue a multi-level project in order to determine genomic, transcriptomic and epigenomic factors substantially involved in shaping the ecogenomic landscape of metabolic syndrome. We will employ series of unique, genetically designed models of inbred, congenic, multiple congenic and recombinant inbred rat strains to map the combinedcontribution of early development, aging, distinct dietary challenges and medication to pathogenesis and alleviation of metabolic syndrome. Rather than identifying set of discrete individual genetic variants, we plan to implement robust statistical models and wide range of molecular to network/pathway analyses in order to reveal functional genomic signatures connected to manifestation of particular subsets of metabolic syndrome, present in human population and modeled in our comprehensive experimentalset. Although the experimental findings cannot be directly translated to human biology, significant insights can be obtained through the comparative and integrative genomics paradigms. The ultimate goal of this project is thus to enhance knowledge of fundamental genome-environmental (ecogenomic) features underlying the metabolic syndrome and create thus a stepping stone in transition to personalized medicine of this prevalent condition.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa

CEP - vedlejší obor

FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa

CEP - další vedlejší obor

FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt splnil plánované úkoly i přes personální problémy (2 studentky odešly v průběhu projektu na mateřskou dovolenou). V rámci projektu byly získány prioritní výsledky, které byly publikovány v mezinárodních časopisech s dobrým IF a skupina se plně integrovala s ústavem 1.Lékařské fakulty, což bylo usnanděno skutečností, že doc.Šeda se stal přednostou ústavu.

Zahájení řešení

16. 3. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 1. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-MSM-LK-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 6. 2017

Celkové uznané náklady

18 685 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

18 685 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč