RNA silencing a mobilní elementy v laboratorním modelu slimáka

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

ERC CZ

Veřejná soutěž

SMSM2024LL001

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-1992/2024-1

Název projektu anglicky

RNA Silencing and Transposable Elements in a Slug Laboratory Model

Anotace anglicky

RNA silencing is a group of important evolutionarily related mechanisms that employ small-RNA guides for sequence-specific gene control, genome protection against transposable elements (TEs), and double-stranded RNA (dsRNA) induced antiviral immunity. Understanding divergence of these molecular mechanisms “in the light of evolution” is strongly biased towards a few model organisms, leaving major gaps across metazoan phylogeny. Mollusca, the second largest animal phylum, which lacks a model organism comparable to C. elegans or D. melanogaster, is a prime case of understudied RNA silencing. The goal of the RT-SLAM project is to unravel molecular mechanisms of RNA-silencing at a depth unprecedented for molluscs. For that, I will develop a terrestrial slug of the genus Deroceras into an accessible, tractable laboratory model with maintenance comparable to that of C. elegans. This development, and making the necessary techniques and resources available for other, is an important subsidiary outcome of RT-SLAM. It will open up a neglected branch of the metazoan evolutionary tree for gaining broader insights into conserved and derived features of other molecular mechanisms. My analysis of another slug Arion vulgaris suggests a unique setup of RNA silencing and response to parasitic nucleic acids, possibly contesting an extraordinary expansion of long interspersed nuclear element (LINE) TEs in its genome and presumed lower viral pressure in the terrestrial environment. RT-SLAM will thus delineate dsRNA responses and how their evolution integrated (or neglected) RNA silencing. Importantly, terrestrial slugs provide a great model to understand the interplay between RNA silencing and expansion of LINEs. I will uncover how RNA silencing in slugs provides an adaptive response to recognize and silence active LINE and how this response expands from the germline to soma. This is also relevant to mammals, where RNA silencing also contests expanding mutagenic LINE L1 elements.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 10. 2024

Ukončení řešení

30. 9. 2026

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

7. 10. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-MSM-LL-R

Datum dodání záznamu

20. 2. 2025

Celkové uznané náklady

23 886 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

23 886 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč