Retrotranspozon kolonizující pouze rekombinující část genomu dvoupohlavních rostlin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 10 (SGA02010GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-10-P483

Název projektu anglicky

Retrotransposon colonizing only recombining part of genome of dioecious plants

Anotace anglicky

Large portions of eukaryotic genomes consist of transposable elements (TEs). Chromosomal distribution and abundance of various families of TEs in genomes is affected by many factors such as the mechanisms of spreading, TEs interactions, TEs vs. host interactions or special features of chromosomal regions. During the systematic analysis of the repetitive sequences in S. latifolia genome, gypsy type LTR retrotransposon family was found. This retrotransposon family gives ubiquitous signal on all chromosomes with exception of the non-recombining part of the Y chromosome where signal is absent. The first hypothesis presumes, that this retrotransposon could be spread in the genome in connection with recombination. Alternative explanation is based on RNA interference mechanism inhibiting retrotransposition in males. Identification of this mechanism(s) could shed light on new connections between retrotranspsoson spreading in sexual organisms, recombination and/or RNAi based TE silencing

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V rámci projektu byly objeveny a charakterizovány i s fylogenetického hlediska rodiny transposozonů Ogre,vykazující limitující kolonizaci genomu u Silene.Projekt originálně zjistil vysokou pravděpodobnost jejich umlčování mechanismem malých sRNA v mužsk?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

27. 1. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GP-U/02:2

Datum dodání záznamu

6. 5. 2016

Celkové uznané náklady

1 897 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 897 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč