Mikrobiomy vybraných extrémních biotopů – jejich fylogenetická diversita a funkční potenciál
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
INTER-EXCELLENCE
Veřejná soutěž
SMSM2019LTA01
Hlavní účastníci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-37785/2019-2
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Microbiomes of Selected Extreme Biotopes – Their Phylogenetic Diversity and Functional Potential
Anotace anglicky
The objective of the proposed project is to characterize microbial populations in extreme biotopes – chronosequence of permafrost (permafrost of differing age) from central Alaska and soils from salt marshes and moffettes of the Soos National Natural Reserve, Czech Republic. The characterization will be conducted by two major routes – metagenomics and modified cultivation techniques. The basic modification of the cultivation techniques will be the use of resuscitation-promoting factor and adjustment of cultivation media so that they better mimic natural conditions the bacteria are subjected to in their habitat; the goal is to increase the efficiency of the cultivation and isolate dormant or otherwise difficult-to-culture or, if possible, as-yet-uncultured bacteria. We also intend to implement MALDI-TOF mass spectrometry for routine species-level determination of bacterial isolates.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10618 - Ecology
OECD FORD - vedlejší obor
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EH - Ekologie – společenstva
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cílem projektu byla kultivační a fylogenetická charakterizace mikrobiálního osídlení extrémních prostředí. Bylo zjištěno, že resuscitační faktor účinně zvyšuje růst půdních bakteriálních druhů, včetně dosud nekultivovaných. Několik fylogeneticky nových taxonů bylo charakterizováno. Fylogenetické a metagenomické analýzy odhalily přítomné a metabolicky aktivní populace ve zkoumaných prostředích.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 11. 2019
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 3. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MSM-LT-U
Datum dodání záznamu
30. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
6 177 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 177 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč