PELAGICS – Eko-genomika mikroorganismů v evropských jezerech
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Grantové projekty excelence v základním výzkumu EXPRO
Veřejná soutěž
SGA0202000004
Hlavní účastníci
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-12496X
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Pan-European Lake Sampling - Microbial Eco-genomics (PELAGICS)
Anotace anglicky
Freshwater habitats are critical for all terrestrial life, yet the vast majority of their microbial inhabitants (pro- and eukaryotes) remain enigmatic, outside the bounds of cultivation. The recent development of novel cultivation methods, coupled with advances in sequencing now provides an opportunity to finally unravel freshwater microbial diversity. The PELAGICS project plans a coordinated pan-European sampling campaign (70 lakes) with 24 collaborating scientists from 16 European countries. With novel media mimicking natural conditions and semi-automated high-throughput isolation we aim for stable cultivation and whole-genome sequencing of 500 prokaryotes and 50 unicellular eukaryotes. Moreover, terabyte scale deep-metagenomic sequencing (ca. 18 TB) will allow recovery of thousands of metagenome-assembled genomes for pro-, eukaryotes and viruses. This large-scale effort will finally uncover the microbial diversity (pro- and eukaryotes), their natural interactions and ecological roles in aquatic food webs.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
K - Končící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GX-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
49 297 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
49 297 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč