Analýza obrazu biologických mikroskopických dat pro měření geometrických charakteristik a strukturních parametrů
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
INTER-EXCELLENCE
Veřejná soutěž
INTER-EXCELLENCE 2 (SMSM2016LTC01)
Hlavní účastníci
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-15304/2017-1
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Image Analysis of Biological Microscopic Data for Measurement of Geometrical Characteristics and Structural Parameters
Anotace anglicky
The project aims to develop new approaches to quantitative analysis of tubular structures in order to study vascular bed in the developing heart and the conduction system in ventricles. For this purpose, we will use transgenic mice model, in which these structures are marked by green fluorescence protein (GFP). We will develop special methods for preprocessing, segmentation and analysis of three-dimensional (3D) digital images of specimens, acquired by confocal microscopy and other microscopic techniques. Further, we will develop methods for measurement of geometrical and topological characteristics of arteries and Purkinje fibres relevant to heart function. The new methods will be thus applied for evaluation of biomedical microscopic image data with a specific outcome in biomedical research connected with diagnostics of developmental disorders and treatment of myocardial infarction.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - vedlejší obor
JC - Počítačový hardware a software
CEP - další vedlejší obor
FA - Kardiovaskulární nemoci včetně kardiochirurgie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>20206 - Computer hardware and architecture<br>30201 - Cardiac and Cardiovascular systems
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byly vyvinuty nové metody pro předzpracování, segmentaci a analýzu trojrozměrných digitálních obrazů vzorků, získaných konfokální mikroskopií, a použity pro měření diagnosticky relevantních strukturních charakteristik cév, nervů a Purkyňových vláken v myokardu. Naše postupy přispějí k diagnostice vývojových poruch srdce a mají využití pro hodnocení cévního řečiště a nervů i v dalších typech tkání.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 6. 2017
Ukončení řešení
30. 4. 2020
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
24. 2. 2020
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-MSM-LT-U/01:1
Datum dodání záznamu
15. 6. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
3 791 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 791 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč