Analýza obrazu biologických mikroskopických dat pro měření geometrických charakteristik a strukturních parametrů

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE

Veřejná soutěž

INTER-EXCELLENCE 2 (SMSM2016LTC01)

Hlavní účastníci

Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-15304/2017-1

Název projektu anglicky

Image Analysis of Biological Microscopic Data for Measurement of Geometrical Characteristics and Structural Parameters

Anotace anglicky

The project aims to develop new approaches to quantitative analysis of tubular structures in order to study vascular bed in the developing heart and the conduction system in ventricles. For this purpose, we will use transgenic mice model, in which these structures are marked by green fluorescence protein (GFP). We will develop special methods for preprocessing, segmentation and analysis of three-dimensional (3D) digital images of specimens, acquired by confocal microscopy and other microscopic techniques. Further, we will develop methods for measurement of geometrical and topological characteristics of arteries and Purkinje fibres relevant to heart function. The new methods will be thus applied for evaluation of biomedical microscopic image data with a specific outcome in biomedical research connected with diagnostics of developmental disorders and treatment of myocardial infarction.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - vedlejší obor

JC - Počítačový hardware a software

CEP - další vedlejší obor

FA - Kardiovaskulární nemoci včetně kardiochirurgie

OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)

10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
20206 - Computer hardware and architecture
30201 - Cardiac and Cardiovascular systems

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly vyvinuty nové metody pro předzpracování, segmentaci a analýzu trojrozměrných digitálních obrazů vzorků, získaných konfokální mikroskopií, a použity pro měření diagnosticky relevantních strukturních charakteristik cév, nervů a Purkyňových vláken v myokardu. Naše postupy přispějí k diagnostice vývojových poruch srdce a mají využití pro hodnocení cévního řečiště a nervů i v dalších typech tkání.

Zahájení řešení

1. 6. 2017

Ukončení řešení

30. 4. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

24. 2. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-MSM-LT-U/01:1

Datum dodání záznamu

15. 6. 2021

Celkové uznané náklady

3 791 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 791 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč