Analýza 3D organizace jaderného genomu u rostlin s kontrastním množstvím jaderné DNA

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE

Veřejná soutěž

INTER-EXCELLENCE 13 (SMSM2018LTC01)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-16506/2018-16

Název projektu anglicky

Analysis of 3D organization of nuclear genome in plants with contrasting amount of DNA

Anotace anglicky

This project aims at understanding the mechanisms controlling the structure and organization of large chromatin domains and chromosomes in different cell cycle stages and tissues in barley and Arabidopsis. Besides of the wild-type plants, we will obtain/develop mutants in several complexes known to control chromosome organization such as cohesin and condensin. To be able to trace chromatin and chromosome dynamics in vivo in barley, we will develop a series of lines carrying translational fusions of marker proteins indicative of specific chromosome domains (e.g. centromere, telomere) with green or red fluorescent protein (GFP or RFP). These lines and their crosses with mutants will be used for molecular-genetic and cytogenetic analysis. We will also examine the effects of cell phenotypes on plant growth and their yield in control and stress conditions of elevated temperature. Therefore, this project will greatly contribute to understanding the dynamics of chromosomes in plant cell nuclei, reaching the aims of the CA16212 INDEPTH and indicate possible directions in breeding genetically more robust plants.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10601 - Cell biology

OECD FORD - vedlejší obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - další vedlejší obor

40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EA - Morfologické obory a cytologie<br>EF - Botanika<br>EI - Biotechnologie a bionika

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V tomto projektu jsme se soustředili na analýzu organizace chromatinu v buněčných jádrech huseníčku rolního a především ječmene setého. Pro ječmen byla vytvořena kolekce unikátních fluorescenčních reportérových linií, které umožňují studium dynamiky chromatinu v živých pletivech. Výsledky projektu byly komunikovány ve formě šesti publikací a devíti prezentací na mezinárodních konferencích.

Zahájení řešení

1. 6. 2018

Ukončení řešení

31. 10. 2021

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

9. 3. 2021

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-MSM-LT-U

Datum dodání záznamu

29. 6. 2022

Celkové uznané náklady

4 428 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 428 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč