MITOCHROM: Změny trojrozměrné struktury jaderného chromatinu rostlin v průběhu buněčného cyklu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

Mezinárodní projekty 13 (SGA0201800003)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

18-14450J

Název projektu anglicky

MITOCHROM: Three-dimensional organization of nuclear chromatin in plants across the cell cycle

Anotace anglicky

Recent methodological advances provided novel insights into the spatial genome organization in mammalian cell nuclei and its functional role. This progress contrasts with the limited knowledge on higher order chromatin folding in mitotic chromosomes. Our preliminary data on chromatin contact frequency at megabase resolution obtained in barley mitotic chromosomes suggest remarkable differences in mitotic chromosome organization between plants and mammals. We will use barley as a model to characterize chromatin folding throughout the cell cycle using chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), super-resolution microscopy, fluorescence in situ hybridization and computational polymer modeling. The project will deliver an experimentally validated structural model of mitotic chromosome organization in barley, elucidate conformational changes occurring across the cell cycle and pinpoint differences in mitotic chromatin organization between plants and mammals.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

OECD FORD - další vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2022

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

25. 3. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GC-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2022

Celkové uznané náklady

8 490 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 215 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 275 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč