Integrativní studium molekulárních mechanismů epitranskriptomu savčích buněk
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
INTER-EXCELLENCE
Veřejná soutěž
INTER-EXCELLENCE 13 (SMSM2018LTC01)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
LTC18052
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Integrative studies of molecular mechanisms of mammalian epitranscriptome
Anotace anglicky
The project is focused on methodical improvement of adenosine modifications in protein coding RNAs (mRNAs) and it mainly aims to integrate studies and look for functional interplay between the two most abundant adenosine modifications in mRNAs, metylation and adenosine deamination. The project brings together research groups from several european institutions with diverse expertise. The topic is in line of the COST Action CA16120 focusing on the establishment of European epitranscriptomic network to facilitate the research development and efficiencz in this young, dynamic and competitive field.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10601 - Cell biology
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se zabývá aktuální tématikou identifikace, detekce a úlohy adenosinových modifikací RNA, které jsou spojovány s řadou klíčových biologických dějů. Byl optimalizován protokol na izolaci RNA a optimalizován přístup pro detekci a kvantifikaci modifikací inosin, m6A, m6Am, m1A, m7G a m227G. Pomocí CRISPR-Cas9 byly připraveny KO linie s alterovanou hladinou exprese klíčových faktorů Klíčovým výsledkem se jeví antagonistický vztah mezi adenosinovou modifikací deaminací a m6A/m6Am v závislosti na typu buňky, respektive tkáně.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 6. 2018
Ukončení řešení
28. 9. 2021
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
9. 3. 2021
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-MSM-LT-U
Datum dodání záznamu
29. 6. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
3 574 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 574 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč