Molekulárně-dynamické simulace modifikovaných nukleových kyselin - potenciálních chemoterapeutik

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Molecular Dynamics Simulations of Modified Nucleic Acids - Potential Chemoterapeutics

Anotace anglicky

The grant project is devoted to the study on the impact of chemical modifications on structural and hybridization properties of synthetic analogues of nucleic acids. Main attention will be paid to finding of an optimal modification leading to thestabilization of double and triple helical structures by means of inter-strand interaction. This post-doc project is attached to the main project within the framework of which the enzymatic stable phosphonate nucleotide analogues will be prepared.Nucleic acids with improved hybridization and enzymatic stability properties are interesting from the point of view of potential chemotherapeutic utilization by means of "antisense" mechanism (modified nucleic acid strand bind to a specific sequence ofnucleotides in its mRNA target to inhibit production of the specific protein). The theoretical approach will be based on molecular dynamics (MD) technique, which allows simulations at non-zero temperature (typically 300 K), with atomic representation of

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

BG - Jaderná, atomová a molekulová fyzika, urychlovače

CEP - vedlejší obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - další vedlejší obor

CD - Makromolekulární chemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10304 - Nuclear physics<br>10403 - Physical chemistry<br>10404 - Polymer science

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Molekulárně-dynamické simulace zodpověděly otázku, jakým způsobem mohou skupiny atomů s kladným nábojem stabilizovat dvojšroubovicovité a trojšroubovicovité struktury nukleových kyselin sestávající z přirozených či a-anomerických vláken nukleových kyseli

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GP-U/06:6

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

1 329 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

693 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

636 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč