Nuclear regulatory landscape of bZIP transcription factors in plant reproductive development (REPROZIP)
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
INTER-EXCELLENCE
Veřejná soutěž
SMSM2020LTC01
Hlavní účastníci
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-21080/2020-16
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Nuclear regulatory landscape of bZIP transcription factors in plant reproductive development (REPROZIP)
Anotace anglicky
The principal objective of this project proposal is to decipher and visualise the complexity of pollen Group E/I bZIP TF nuclear regulatory landscape in relation to chromatin dynamics during Arabidopsis pollen development and under the effect of environmental cues. For this, we will take the advantage of our model material being effectively single cell system – naturally synchronised population of developing spores and growing pollen tubes. To demonstrate the function of bZIP regulatory landscape in pollen it will be necessary to visualise bZIP proteins and their interactions and to identify their downstream pathways, target genes and binding sites. This will be achieved by the functional characterization of bzip double mutants and by the combination of transcriptomic (RNA-seq), proteomic (LC-MS/MS) and lipidomic (LC-MS) approaches that will be compared to the previously published bzip34 and bzip18 microarray data. As all bZIP genes of interest were demonstrated to interact in the Y2H assay, we aim to clarify whether they co-operate on the same regulatory pathway(s) and whether they form native functional and/or regulatory complexes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EF - Botanika
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt byl úspěšně ukončen
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 6. 2020
Ukončení řešení
12. 5. 2023
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
17. 2. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-MSM-LT-U
Datum dodání záznamu
1. 7. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
5 272 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 272 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč