Fluorinated carbohydrates: A valuable tool to study glycan-protein interactions and remodel cell-surface glycome

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE

Veřejná soutěž

SMSM2020LTC01

Hlavní účastníci

Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-21080/2020-26

Název projektu anglicky

Fluorinated carbohydrates: A valuable tool to study glycan-protein interactions and remodel cell-surface glycome

Anotace anglicky

The objectives of the project are divided into three areas according to their scientific nature. 1) Synthesis. The objectives in this area are 1a) The synthesis of a complete library of systematically deoxofluorinated deprotected analogs of LacNAc, LacdiNAc and diacetylchitobiose ready for determination of binding affinity, and for NMR epitope mapping; 1b) The synthesis of systematically deoxofluorinated GlcNAc, GalNAc, and ManNAc protected at hydroxyl groups as acetyl, propionyl and butyryl esters; 1c) Preparation of a limited number of protected disaccharide units of GAGs intended as a demonstration of the feasibility of this first step towards assembly of functional segments of fluorinated GAG. 2) Ligand recognition. The objectives in this area are 2a) Determination of the binding affinity of deoxofluorinated LacNAc, LacdiNAc and diacetylchitobiose analogs towards their cognate lectins by ELISA and ELLA assays; 2b) Epitope mapping of LacNAc, LacdiNAc and diacetylchitobiose using advanced NMR techniques. 3) Metabolic inhibition. The objectives in this area are 3a) Identification of deoxofluorinated acylated hexosamines usable for manipulation of cell-surface glycome by metabolic inhibition; 3b) Determination of how the cell-surface glycome has been altered after treatment with compounds identified under 3a.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10401 - Organic chemistry

OECD FORD - vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)

CC - Organická chemie
CE - Biochemie
EB - Genetika a molekulární biologie

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt zahrnuje syntézu tří kompletních sérií fluorovaných disacharidů, stanovení jejich afinit k lektinům, syntézu a cytotoxicitu fluorovaných aminosacharidů a jejich organometalických konjugátů, NMR analýzu interakcí s galektinem 1 a 3, a konformační analýzu. Vyšly tři publikace v impaktovaných časopisech a další dvě se připravují.

Zahájení řešení

15. 5. 2020

Ukončení řešení

7. 4. 2023

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 2. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MSM-LT-U

Datum dodání záznamu

1. 7. 2024

Celkové uznané náklady

4 119 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 119 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč