Teoretické studium struktury, dynamiky a funkce RNA a jejich vzájemných vztahů
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT
Veřejná soutěž
KONTAKT 7 (SMSM2009ME4)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
2060/2011-320
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Theoretical investigation of RNA structure, dynamics and function and their relationship.
Anotace anglicky
(1) Finding new information about structure, dynamics and function of small RNA molecules (e.g. RNA aptamers, riboswitches) by applying methods of computational chemistry in close collaboration with experts from CU Boulder (e.g. experimentalist Mike Yarus and bioinformatist Rob Knight). (2) Characterization of binding sites (example: tryptophan aptamer) and design of new, fully functional structures. (3) Characterization of free and bound form of riboswitches and the conformational changes caused by ligand binding (example: SAM riboswitch).
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - další vedlejší obor
BO - Biofyzika
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V roce 2012 jsme pokračovali ve studiu RNA aptamerů, konkrétně v modelování TRP a HIS aptamerů. Navrženou strukturu komplexu ligand:aptamer a vypočtené vazebné konstanty jsme následně porovnali s experimentálními údaji. Zahájili jsme také teoretické stu?
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 4. 2009
Ukončení řešení
31. 12. 2012
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
23. 2. 2012
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP13-MSM-ME-U/01:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2013
Finance
Celkové uznané náklady
1 660 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 660 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč