Mitočip: příprava DNA čipu pro analýzu exprese mitochondriálních genů a jeho aplikace ve studiu molekulární podstaty nukleárně kodovaných poruch respiračního řetězce

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví

Veřejná soutěž

VaV pro Ministerstvo zdravotnictví 1 (SMZ02004NR)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

MitoChip: microarray for mitochindrial gene expression analysis and its application for study of nuclear defects of oxidative phosphorylation

Anotace anglicky

Deficiencies of oxidative phosphorylation (OXPHOS) form important group of severe genetic diseases which prevalence is estimated at 1:8000. About half of the OXPHOS deficiencies results from mutation of nuclear encoded mitochondrial genes. Gene expression profiling represents a new method which has a potential to contribute significantly to differential diagnosis and research of nuclear OXPHOS deficiencies. The aim of the project is development of MitoChip - oligonucleotide microarray for expression profiling of all of human mitochondrial genes and gene expression profiling of control and pathological samples from various patients with OXPHOS deficiencies. The objectives of the analyses will be comparison of gene expression patterns of patient and control samples, search for disease specific gene expression patterns, search for potential candidate genes in not yet defined nuclear defects.

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

FG - Pediatrie

CEP - další vedlejší obor

FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)<br>30209 - Paediatrics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl připraven DNA čip umožňující analýzu genové exprese 1632 genů účastných v mitochondriální biologii a analyzován soubor pacientů s deficitem mitochondriální ATPasy. Byly definovány kandidátní onemocnění podmiňujících geny.

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-MZ0-NR-U/06:2

Datum dodání záznamu

8. 8. 2007

Celkové uznané náklady

6 198 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 060 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč