Celoexomové sekvenování, sekvenování genomu s nízkým pokrytím a transkriptomu pro účely precizní onkologie u dětských pacientů s vysoce rizikovými a relabovanými solidními nádory

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
Veřejná soutěž
SMZ0202000001
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NU20-03-00240

Název projektu anglicky
Whole exome, low-coverage genome and transcriptome sequencing as tools for precision oncology in paediatric patients with high-risk and relapsed solid tumors
Anotace anglicky
Children with high-risk and relapsed solid tumors represent 15-20% of children with malignant disease in whom current treatment approaches remain unsatisfactory. In these cases new and individialized treatment strategies are necessary. Essential condition for effective therapy is not only a detailed histopathological characterization of the tumor, but also its adequate molecular biological examination. There are several changes in the tumor that can drive its tumorigenesis, e.g. small substitutions, amplification of oncogenes and deletion of tumor suppressors or gene overexpressions. Mentioned events can be identified by modern methods based on next-generation sequencing. Some of these changes represent potential actionable target, others are important prognostic factors. The overall aim of this project is an utilization of whole exome sequencing, genome sequencing with low coverage and transcriptome sequencing as important tools for therapeutic planning in pediatric patients with high-risk solid tumors.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30204 - Oncology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
FD - Onkologie a hematologie

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt přináší vynikající výsledky, které naplňují stanovené cíle a prokazují významný přínos kombinace celoexomového a celogenomového sekvenování spolu s analýzou transkriptomu pro identifikaci molekulárních cílů a individualizaci léčby u vysoce rizikových dětských pacientů se solidními nádory. Ukázal, že tento přístup umožňuje nalézt terapeuticky ovlivnitelné alterace u 39% pacientů, a poskytuje tak cenné vodítko pro volbu cílené léčby u populace s dosud neuspokojivými výsledky terapie. Kvalitu a význam dosažených výsledků dokládá publikování v prestižních zahraničních časopisech (7 prací s IF 3,8-41, další 2 přijaté/zaslané) a prezentace na konferencích. Díky multidisciplinárnímu charakteru projekt propojuje základní výzkum s aplikacemi v klinické medicíně a přispívá k rozvoji precizní onkologie. Řešení probíhalo plně v souladu se schváleným plánem, bez nedostatků ve využívání přidělených finančních prostředků.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-MZ0-NU-U
Datum dodání záznamu
3. 7. 2024

Podobné projekty(10)