Studie využitelnosti sekvenování nové generace pro individualizovanou léčbu pacientů se solidními nádory

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV19-08-00113

Název projektu anglicky
Feasibility study of next generation sequencing for individualized therapy of patients with solid tumors
Anotace anglicky
Search for molecular biomarkers enabling prediction of cancer treatment efficacy and establishment of optimal method for their assessment represent major opportunities, but also challenges in translational research. This project aims to explore feasibility of the next generation sequencing method for discovery of Czech population-specific genetic biomarkers for stratification of cancer patients into prognostically meaningful groups. Genetic background of patients treated with adjuvant chemotherapy regimens based on nucleoside analogs, taxanes and platinum derivatives will be explored by whole exome profiling method in cancer patients of Czech origin for the first time. Results will be compared with data in publicly available databases as TCGA and ICGC and with data from Czech NCGM genetic variability project. Panel of germline variants and somatically relevant genes for prognostication of patients will subsequently be validated and its cost efficacy and benefit will be evaluated in comparison with the whole exome approach.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])
OECD FORD - vedlejší obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EB - Genetika a molekulární biologie<br>FS - Lékařská zařízení, přístroje a vybavení

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt úspěšně zkoumal genetické varianty u pacientů s maligním onemocnění pomocí celoexomového sekvenování. Hlavním cílem bylo vytvoření české databáze genetických variant u pacientů s kolorektálním karcinomem, pankreatickým adenokarcinomem a epiteliálním karcinomem ovaria. Tomuto cíli se projekt po celou dobu úspěšně věnoval. Poznatky získané v projektu významně posouvají znalosti o vztahu mezi genetickým statusem pacienta a prognózou jeho nádorového onemocněním. Nové poznatky se také otvírají cesty k potenciálnímu zlepšení personalizované terapie. Získané nové znalosti bylo publikovány v renomovaných časopisech. Z pohledu onkologie a zdravotní péče je třeba velmi pozitivně zhodnotit skutečnost, že uvedené karcinomy jsou velmi závažná onkologická onemocnění s významnou incidencí i mortalitou. Projekt byl řešen bez formálních nedostatků.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
3. 7. 2024

Podobné projekty(10)