Molekulárně genetická charakterizace dětských mozkových nádorů asociovaných se syndromy predispozice k nádorovým onemocněním

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026

Veřejná soutěž

SMZ0202100001

Hlavní účastníci

Fakultní nemocnice v Motole

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NU21-07-00419

Název projektu anglicky

Unique molecular biology of paediatric brain tumours associated with cancer predisposition syndromes

Anotace anglicky

Aetiology of paediatric tumours is largely unknown. Recent retrospective studies suggest that around 10% of patients harbour cancer predisposition syndrome (CPS). These studies are usually limited to the certain subgroup of patient, evaluate only limited panel of genes and describe mainly single nucleotide variants (SNV) or short indels. There is a lack of studies describing larger germline DNA changes (focal or segmental deletions). Those are some of many reasons why the incidence of cancer predisposition syndromes in children with brain tumours is unknown, and therefore we aim to determine frequency of CPS in prospective cohort of patients using whole-exome sequencing. Our analysis pipeline is established to reveal not only SNV, but also broader changes using copy number variant (CNV) analysis. Furthermore, we plan examine brain tumour tissue from patient with CPS using whole-exome sequencing and whole-genome methylation array to discern biological differences compared to their sporadic counterparts. Because of close collaboration with large international paediatric neurooncology centres (Heidelberg and Toronto) we will have validation cohort of genetically and epigenetically defined brain tumours available to validate our results. Upon completion of this project we will be able to estimate real incidence of cancer predisposition syndromes in brain tumour paediatric patients. Moreover, we will demonstrate biological differences of cancer predisposition associated brain tumours which will have significant impact on the diagnostics and tremendous therapeutic implications for these patients.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30101 - Human genetics

OECD FORD - vedlejší obor

30209 - Paediatrics

OECD FORD - další vedlejší obor

30204 - Oncology

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie<br>FD - Onkologie a hematologie<br>FG - Pediatrie

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V průběhu řešení projektu byla vytvořena prospektivní kohorta 171 nově diagnostikovaných dětských pacientů s nádory centrálního nervového systému (CNS). Celkem bylo identifikováno 29 pacientů s patogenní germinální variantou v genech spojených s onkogenním potenciálem. Kromě již známých predispozic se podařilo odhalit varianty v genech, které dosud nebyly spojovány s rizikem rozvoje nádorů CNS. Nádorové vzorky byly analyzovány pomocí celogenomové methylace (methylation array) a celogenomového sekvenování exomu (WES). Získané poznatky o biologických odlišnostech jednotlivých nádorových onemocnění otevírají nové možnosti pro úpravu léčebných postupů a přispívají k rozvoji personalizované medicíny. Výsledky projektu plně odpovídají stanoveným cílům, mají zásadní význam pro oblast dětské onkologie a přispívají k dalšímu rozvoji personalizované medicíny. Dosažené výsledky byly publikovány v řadě vysoce kvalitních odborných časopisů s impaktovaným faktorem.

Zahájení řešení

1. 5. 2021

Ukončení řešení

31. 12. 2024

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 4. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-MZ0-NU-U

Datum dodání záznamu

1. 7. 2025

Celkové uznané náklady

13 486 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

13 486 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč