Neznámá příčina DFNB1 hluchoty u pacientů s pouze jednou patogenní mutací v GJB2 genu – komplexní analýza pomocí nových molekulárně genetických metod.

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 2 (SMZ0201601)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
16-31921A

Název projektu anglicky
Unknown cause of DFNB1 deafness in patients with only one pathogenic GJB2 gene mutation – complex elucidation by new molecular genetic approaches.
Anotace anglicky
Early non-syndromic hearing loss is a major health concern. Inheritance is mostly autosomal reccessive (in 80%). In our previous study we observed that mutations in the GJB2 gene cause up to 40 % of early nonsyndromic deafness in Czech patients. But in a significant part of patients with non-syndromic hearing loss only one heterozygous pathogenic GJB2 mutation (on one allele of the GJB2 gene) is found despite testing for other known factors (mutation in non-coding exon 1 and the large deletion affecting the GJB6 gene). This problem is global. This project aims to find the second, still unknown , but assumed factor-mutation, which is responsible for the hearing impairment in these patients. DNA samples of deaf heterozygotes with only one detectable pathogenic mutation in GJB2 gene will be tested for possible smaller chromosomal rearrangements on chromosome 13 q ( DFNB1 locus with GJB2 and GJB6 genes) using array comparative genomic hybridization (aCGH). Finding of such an assumed recurrent rearrangement would clarify the cause of deafness in such patients and families and would be...

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
FF - ORL, oftalmologie, stomatologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory (dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) 10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3) 10605 - Developmental biology 10608 - Biochemistry and molecular biology 10609 - Biochemical research methods 30101 - Human genetics 30206 - Otorhinolaryngology 30207 - Ophthalmology 30208 - Dentistry, oral surgery and medicine

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
1. Odborný přínos projektu: Řešitelé projektu vyvrátili původně stanovenou hypotézu o existenci dalších patogenních mutací u pacientů s hluchotou, kteří mají již známou heterozygotní patogenní mutaci v genu GJB2. Naopak, metodou celoexomového sekvenování, identifikovali mutace v jiných genech/lokusech u 19% pacientů. Genetickou diagnostiku a poradenství dědičné hluchoty tak je možné rozšířit o nově nalezené geny a zavedení WES je ekonomicky výhodné a klinicky relevantní. Lze tedy konstatovat, že hlavním dosavadním přínosem projektu je získání zkušeností s celoexomovým sekvenováním pro řešitelské pracoviště a publikace výsledků. Hlavním výsledkem řešení projektu jsou 3 práce v impaktovaných časopisech. 2. Charakteristika výsledků: Výsledky představují veřejně přístupné publikace v odborné literatuře. Výstupy souhlasí s deklarovanými cíli v projektové přihlášce. V souladu s externím oponentem lze konstatovat, že dvě ze tří prací se nevztahují přímo k předmětu řešení, pouze k metodic

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-MZ0-NV-U/03:1
Datum dodání záznamu
25. 6. 2021

Podobné projekty(10)