Cesty šíření, evoluce, adaptace a význam antibiotické rezistence: aplikace celogenomové sekvenace

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
Veřejná soutěž
SMZ0202000001
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NU20J-05-00033

Název projektu anglicky
Antibiotic resistance routes of dissemination, means of evolution and adaptation: Incorporating WGS in the equation
Anotace anglicky
Growing incidence of bacteria resistant to last-line antibiotics represents one of the most important medical issue, complicating the successful treatment of life-threatening infections. In this project, molecular-epidemiological and genomic analysis of carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) isolated from patients in Czech hospitals and its comparison with the carbapenem-susceptible population will be performed. Whole genome sequencing and bioinformatics analysis will allow to identify specific features of CPE, high-risk clones with increased importance for public health and mobile genetic elements associated with the dissemination of resistance to carbapenems in hospitals. Complex genomic analysis will reveal genetic structure of the studied bacterial populations including their dynamics through microevolutionary changes in the clinical context of a hospital outbreak. The project outcomes will be used to improve the diagnostics of infectious diseases and to outline effective interventions for the prevention and control of the transmission of bacterial pathogens.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Odborným přínosem projektu je zejména objasnění šíření bakteriálních klonů a plazmidů nesoucích geny pro rezistenci, nejen ke karbapenemům. Při jeho řešení byly použity nejmodernější metody molekulární biologie včetně sekvenace tzv. dlouhých čtení, které umožňují lepší charakterizaci struktury bakteriálních genomů. Získané výsledky jsou cenné nejen pro obor klinické mikrobiologie, ale také pro epidemiologické studie a infekční lékařství. Výstupy projektu jsou doloženy a přehledně prezentovány. Jednoznačně předčí původní cíle a přesahují nároky očekávané od řešení Juniorského projektu. Projekt nemá závažné nedostatky v podobě odchýlení se od zadávací dokumentace nebo v čerpání finančních prostředků.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-MZ0-NU-U
Datum dodání záznamu
3. 7. 2024

Podobné projekty(10)